دستيابي پژوهشگران دانشگاهي به عامل ويروس پيچيدگي برگ سيبزميني در كشور
دستيابي پژوهشگران دانشگاهي به عامل ويروس پيچيدگي برگ سيبزميني در كشور
پژوهشگران گروه بيماريشناسي گياهي دانشگاه تربيت مدرس طي تحقيقي تنوع ژنتيکي ويروس پيچيدگي برگ سيب زميني در ايران را بررسي کردند. نتايج نشان داد که جدايههاي PLRV ايران از طريق غدههاي آلوده از کشورهاي اروپايي وارد شده است. سيب زميني يکي از منابع غذايي مهم است و در اکثر مناطق زراعي ايران کشت ميشود. ويروس پيچيدگي برگ سيب زميني (PLRV) باعث کاهش عملکرد اين محصول ميشود.
ندا زند، کارشناس ارشد بيماريشناسي گياهي و مجري اين طرح پژوهشي ضمن بيان اين مطلب در خصوص ساختار ژنتيکي اين ويروس اظهار كرد: ژنوم PLRV از يک مولکول RNA تک رشتهاي مثبت که داراي هشت چارچوب خواندني باز(open reading frame, ORF) است، تشکيل شده است. با وجود تنوع ويژگيهاي بيولوژيکي استرينهاي PLRV، مقايسه توالي نوکلئوتيدي طول کامل RNA ژنومي PLRV تنوع بالايي را نشان نميدهد، در حاليکه ORF0 نسبت به ساير قسمتهاي ژنوم، تنوع بيشتري دارد و منطقه بحراني براي بروز تغييرات ژنتيکي و حوادث تکاملي اين ويروس است که ميتواند براي تعيين تنوع ژنتيکي جدايههاي PLRV استفاده شود.وي در ادامه به تشريح مراحل پروژه تحقيقاتي خود پرداخت و افزود: 210 نمونه سيب زميني از استانهاي اردبيل، همدان، اصفهان، کرمانشاه، چهارمحال بختياري و آذربايجان شرقي که داراي علائم آلودگي به PLRV بودند، جمعآوري و به وسيله آزمون TAS-ELISA بررسي شدند.
نتايج نشان داد که از 210 نمونه بررسي شده، 56 نمونه آلوده به PLRV بودند. سپس RNA تعدادي از نمونههاي آلوده استخراج و تکثير شد. قطعات تکثير شده به حامل pTZ57R/T متصل شدند و سپس به باکتري E.coli سويه DH5 منتقل شدند.زند خاطرنشان كرد: براي تعيين صحت دقيق همسانهسازي، واکنش nested-PCR با استفاده از همسانههاي بدست آمده و آغازگرهاي اختصاصي، انجام و ژن ORF0 تکثير شد. توالي نوکلئوتيدي ORF0 مربوط به همسانهها تعيين شد و تجزيه و تحليل تواليها نشان داد که بين توالي ORF0 جدايههاي ايراني PLRV با تواليهاي موجود در NCBI 94 تا 99.4 شباهت وجود دارد.پژوهشگر دانشگاه تربيت مدرس همچنين تصريح كرد: رسم درخت فيلوژنتيکي به روش ML توالي نوکلئوتيدي ORF0 34 جدايه، آنها را در سه گروه مجزا قرار داد.
گروه اول شامل جدايه اروپايي و يک جدايه از پرو و سه جدايه از تونس بود، گروه دوم شامل جدايههاي استراليا و کانادا به همراه جدايههاي استان اردبيل و کرمانشاه بود. گروه سوم شامل ساير جدايهها از ساير نقاط دنيا و همچنين جدايههاي آذربايجان شرقي، چهارمحال بختياري و اصفهان بود.زند در پايان گفت: اين نتايج نشان ميدهد که جدايههاي PLRV ايران از طريق غدههاي آلوده از کشورهاي اروپايي وارد شده است. اين پژوهش با راهنمايي دکتر مشعود شمس بخش، عضو هيات علمي دانشکده کشاورزي دانشگاه تربيت مدرس انجام شده است.